Die Zusammenarbeit mit Partner*innen (Kantone, Städte, Institutionen, Private) dient der Förderung des nationalen und internationalen kulturellen Austauschs im Bereich zeitgenössischer Kunst für befristete Arbeitsaufenthalte von Künstler*innen — das sogenannte Artists-in-Residence-Programm. Die Fundaziun Nairs möchte alle Sprachregionen der Schweiz unter einem Dach vereinen sowie regionale, nationale und internationale Künstler*innen in einen aktiven und langfristigen Dialog einbinden.
Aktuelle Atelierpartnerschaften bestehen mit dem Aargauer Kuratorium, Pro Helvetia und der Stichting Stokroos aus den Niederlanden.